山西醫科大學藥學院始建于1979年，是山西省最早培養藥學專業人才的教育基地。

40年來，藥學院秉承艱苦創業、立德樹人的優良傳統，傳承“醫理博精、德能高邃”的山醫校訓，謹遵“獻身、務實、團結、進取”的山醫校風，堅守“求實精進、堅韌弘毅”的山醫精神，堅持嚴謹治學、勇于創新的發展理念，現已發展壯大成為山西省藥學本科、碩士、博士多層次高等教育的重要基地。目前在校本科生規模約1300人，在校博、碩士研究生規模約300人。占地面積近1萬平方米，近三年投入2300余萬元，固定資產達4200余萬元。為社會培養應用型藥學專業人才4000多人，培養研究型藥學博士、碩士高級人才近500余人。

截止2023年4月，學院現有教職工84人，其中專任教師76人，教授17人，副教授17人，具有博士學位教師59人，博士生導師16人，碩士生導師50人（含兼職導師），山西省教學名師1人，山西省高校創新拔尖人才3人，山西省三晉人才4人，山西省青年學術帶頭人2人，國家級人才非全職特聘教授4人。擁有藥學一級學科博士點和藥學碩士專業學位授權點；擁有藥學、中藥學、臨床藥學三個本科專業。藥學專業是首批國家一流本科專業建設點、教育部高等學校特色專業建設點、山西省品牌專業、山西省優勢專業；中藥學專業為山西省高等學校一流本科專業建設點、山西省特色專業；臨床藥學專業為國家一流本科專業建設點。學院擁有山西省藥物合成和制劑新技術重點實驗室、山西省特色藥物研制工程研究中心、山西省藥學實驗教學示范中心、山西省虛擬仿真實驗教學中心、山西省藥學研究生教育創新中心、山西省優秀科技創新團隊、山西省道地藥材資源開發工程技術中心及山西省服務制藥產業創新學科群等多個教學科研團隊和服務平臺。